（1）工業(yè)污水處理工程中由于厭氧類型的微生物代謝和繁殖較為緩慢，所以為了增殖構(gòu)筑物中生物量要花費(fèi)較長時(shí)間去培養(yǎng)，因而厭氧處理工藝啟動時(shí)間長，水力停留時(shí)間一般都比好氧處理方法長；

（2）一般情況下，工業(yè)污水處理工程中厭氧微生物處理法出水水質(zhì)都不能符合排放標(biāo)準(zhǔn)的要求，需要更進(jìn)一步處理，因此在厭氧微生物處理法后面需要配合好氧處理工藝一起使用；

（3）工業(yè)污水處理工程中厭氧法生物處理工藝流程比好氧的工藝復(fù)雜，操作和管理比較復(fù)雜；

（4）厭氧類型微生物雖然可以在較低的溫度下生存，但活性較差，廢水溫度低時(shí)對處理效果的影響很大，為了保證廢水的處理效果往往需要用外熱源加熱，需要將水溫加熱，一般中溫的厭氧類型的微生物處理廢水的佳溫度（35~38攝氏度）；

（5）厭氧類型的微生物在處理含有硫化物的廢水時(shí)，會產(chǎn)生硫化氫，硫化氫是一種具有難聞的氣味的氣體，而且部硫化氫會引起管道及污水站的其他設(shè)備的腐蝕；

（6）厭氧類型的微生物處理對廢水沒有硝化作用，為了保證厭氧類型的微生物較高的生物活性，要求NH4+濃度在40到70毫克每升。同時(shí)這也決定了單純只采用厭氧的處理方法是無法處理高氨氮的廢水。

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